【肛門(こうもん)】とは、消化管の出口のこと。
解剖学的には直腸の体外への開口部。肛門括約筋によって制御される。表面は粘膜でおおわれ、その外側に内肛門括約筋、外肛門括約筋がある。内肛門括約筋は不随意筋で、自らの意思では動かせず、常に締まる状態にある。外肛門括約筋は随意筋で、自らの意思で動かせ、排泄等の場合になどする。
また、SMにおいては肛門に男性器を挿入するアナルセックスや、肛門に手を入れることにより性的快感を得るアナルフィスト、肛門に浣腸を行い自分や他人に対して強制的に排泄行為をさせるという浣腸プレイといったプレイカテゴリーがある事も有名ある。
肛門は、目、鼻、口、膣と並び、粘膜に触れることがたやすい部位のため、急所として扱われる。格闘技では、肛門に指を突っ込む行為は禁止されているが、緊急の護身術としては有効な手段になる。
肛門は直腸に直結している為、肛門から大きな異物や傷をともなうと、死につながることがある。拷問、刑罰としての串刺しでは、女性には膣、男性には肛門に串を突き刺した。